文昌市境内公路四通八达。海文高速公路全长56公里，文城镇至美兰国际机场36公里。向西、向南均可接通海榆东线和东线高速公路。全市各镇已实现全部公路通车，98%的村委会和97%的自然村公路通车。全市公路通车里程达1646公里，其中国道1条9公里，省道6条227.557公里，县市道19条221.7公里，乡道1187.25公里。有海口到文昌的省汽直快。

       水上运输主要有清澜港和铺前港两大港口，是海南东部的水上门户，海上交通可直达全国各港口及香港和东南亚个国。清澜港是国家一级开放口岸，有到西沙永兴岛的补给船——琼沙2号，该船每月去一趟永兴岛运送补给物品，它同时也是西沙群岛上军民返往的交通工具。琼沙2号一般在每月28日下午4点从清澜港开船，在风平浪静的情况下，航行时间一般为16个小时，在次日上午8:30左右到达永兴岛。船在永兴岛逗留一夜，到第三天下午5点返航，第四天上午9:30左右回到清澜港。